我们知道任何药物在使用过程中都可能有一定的副作用，枯草杆菌二联活菌肠溶胶胶囊在使用过程中也可能有一定的副作用。例如，它可能会引起恶心、头痛、头晕等。
枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊中的两种活菌包括粪便肠球菌和枯草杆菌。其主要功能是服药后直接补充人体正常活菌，抑制肠道内其他有害细菌的过度繁殖，调节肠道菌群。
目前，在使用过程中，主要可用于治疗肠道菌群紊乱引起的腹泻或便秘或消化不良、肠炎、腹胀等。如果服用方法是12岁以上的儿童和成人，一次口服一到两粒，一天口服两到三次，或者我们可以根据医生的建议服用药物，但需要注意的是，如果对某些微生态药物过敏，严禁使用药物。
此外，在用药时，如果患者在使用一个月后仍没有明显改善，必须停止用药到医院，应保存在室温干燥和避光处。
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